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毕业后，马中骐留在高能所工作，始终从事理论物理研究，重点在群论方法及其物理应用，一直到2005年退休。他在1991年获评“做出突出贡献的中国博士学位获得者”，1992年10月起享受政府特殊津贴，先后三次获得中科院科技进步二等奖。

物理学家、诺贝尔奖获得者杨振宁评价马中骐的研究成果是“能留得下来的工作”。“像杨先生那样，留个山头下来当然了不起。”马中骐说他的工作像“小砖头”，“大水来的时候，泥沙都被冲走了，但‘小砖头’能留下来”。

4个月时间，马中骐就完成了毕业论文写作。1982年2月6日，马中骐在高能所的一间教室里作了论文答辩。答辩委员会阵容豪华，由7位物理学界的顶级专家组成：主席是“两弹一星”元勋彭桓武，还有胡宁、朱洪元、戴元本、谷超豪4位学部委员。

马中骐是新中国培养的第一位博士，曾被国家教委和国务院学位委员会评为“做出突出贡献的中国博士学位获得者”，并获王淦昌物理奖等多个奖项。

“南方周末”微信公众号去年11月曾刊文《“新中国第一号”博士》介绍了马中骐先生的人生故事。文章介绍，马中骐来自中国科学院高能物理研究所，核物理学家、时任中科院数理学部主任、学部委员钱三强签发了他的博士学位证书，证书编号是“10001”，新中国第一号。现在，这份学位证书被中国国家博物馆收藏。

“第一批获得博士学位的研究生，有一个明显的特点，就是年龄偏大，一般在四十岁左右。”现场的发言中，马中骐提到了年龄。当时，马中骐43岁。从他第一次读研，到拿到博士学位，用了16年。

“憋了十年不能搞科研，急得很。”接受南方周末记者采访时，马中骐说。由于此前已有学术积累，这回，他在高能所成为了同学们的“大师兄”。

1980年2月，第五届全国人大常委会第13次会议上，审议通过《中华人民共和国学位条例》，学士、硕士、博士三级学位建立。条例从1981年起实施。中国科学院研究生院、中国科技大学、复旦大学、山东大学、华东师范大学成为首批试点单位,开始培养博士。

马中骐回忆，这年8月，组织上同他谈话，决定在研究生里挑一批底子好的，直接当博士生。他被选为“试点”，要求“抓紧写篇高水平博士论文出来”。

直到10年后，1977年，国务院批转教育部《关于高等学校招收研究生的意见》，研究生教育得以恢复。1978年，38岁的马中骐再次考取胡宁的研究生，进入中科院高能物理研究所(以下简称“高能所”)。

黑料社网页版澎湃新闻记者从中国科学院高能物理研究所方面获悉，该所研究员马中骐先生，于2024年5月28日因病在南京逝世，享年85岁。

1956年，16岁的马中骐进入兰州大学物理系，毕业后留校任教。1964年，国家动员在职干部考研究生，马中骐考入北京大学物理系，师从理论物理学家、中科院学部委员胡宁。1967年，马中骐回到兰州大学。